九州旅客鉄道(JR九州)は、大雨に伴う7月7日の運転計画を発表した。(7月6日20時45分現在)
【九州新幹線】博多~熊本間は通常どおり運転、熊本~鹿児島中央間は始発から運休。
【特急列車・D&S列車】「かもめ」始発から運休、100号、102号、104号、108号、101号、103号のみ運転、「みどり」始発から本数を減らして運転、「ハウステンボス」始発から運休、「かわせみ・やませみ」終日運休、「いさぶろう・しんぺい」終日運休、「きりしま」始発から運休・102号のみ運転、「指宿のたまて箱」1号2号運休。
【快速列車・普通列車】鹿児島本線羽犬塚~熊本・始発から運転見合わせ、熊本~八代・始発から本数を減らして運転、川内~鹿児島中央・終日運転見合わせ、久大本線久留米~日田・始発から運転見合わせ、長崎本線肥前鹿島~長崎・始発から運転見合わせ、佐世保線肥前山口~佐世保・始発から本数を減らして運転、大村線早岐~諫早・始発から運転見合わせ、肥薩線八代~吉松・終日運転見合わせ、吉松~隼人・始発から運転見合わせ、日豊本線南宮崎~西都城・始発から本数を減らして運転、西都城~鹿児島中央・始発から運転見合わせ、吉都線吉松~都城・始発から運転見合わせ、日南線南宮崎~志布志・始発から運転見合わせ、指宿枕崎線鹿児島中央~枕崎・始発から運転見合わせ。
気象状況により、ほかにも遅延、運休、行先変更等が発生する場合がある。